Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms