Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNAPC1Q16533 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNAPC1Q16533 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNAPC1Q16533 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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