Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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