Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms