Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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