Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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