Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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