Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CST6Q15828 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms