Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB3Q15768 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB3Q15768 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB3Q15768 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB3Q15768 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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