Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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