Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms