Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms