Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDAP1Q13442 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms