Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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