Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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TRAF1Q13077 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TRAF1Q13077 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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