Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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