Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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