Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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