Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms