Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms