Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms