Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms