Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms