Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms