Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms