Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms