Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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