Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMFBP60983 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMFBP60983 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMFBP60983 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMFBP60983 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms