Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA6P60900 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA6P60900 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms