Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms