Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23BP54727 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms