Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms