Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HK3P52790 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HK3P52790 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HK3P52790 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HK3P52790 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms