Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR4P51571 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR4P51571 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR4P51571 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR4P51571 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR4P51571 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms