Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSEN1P49768 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms