Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms