Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms