Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ME1P48163 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ME1P48163 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms