Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNPDA1P46926 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNPDA1P46926 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNPDA1P46926 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNPDA1P46926 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms