Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms