Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms