Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms