Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms