Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARGP37231 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms