Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms