Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms