Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms