Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms