Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms