Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms